根据《实验室资质认定评审准则》为了有效进行质量管理，确保服务质量，实现质量方针和目标、履行承诺，实验室必须建立并有效实施管理体系。
许多实验室建立了管理体系，但在运行中效果却不大一样，为了保证实验室管理体系能够正常有效的运行，需注意以下几点：
1、领导必须重视实验室并了解质量体系中自己的作用，在质量管理、技术服务工作中全力支持质量负责人、技术负责人；
2、在质量体系运行过程中相关人员职责分配要细化，特别是交叉职责和边缘职责，最好对程序文件、作业指导书也提出具体职责分配；
3、搞好内审，内部审核是质量体系能否得到持续改进的关键步骤之一；
4、记录是一种证据，所以做好档案管理非常重要，并要保证做好分类、及时归档、定期整理；
5、例外许可在一定程度上是违反质量体系的，尤其是边缘许可一定要慎重，杜绝偏离体系的想象；
6、做好抱怨记录；
7、体系的建立与时间、环境有很大关系，当外界条件引起体系改变时，应及时修改体系文件；
8、体系运行的好坏，一定程度上取决于员工对体系的理解程度，为使员工更深入了解管理体系在实验室建设中的重要性，采取各种方式的管理体系文件宣贯是必不可少的。
